Identificación molecular de cepas del complejo C. parapsilosisprocedentes de muestras clínicas

Abstract

Las especies del complejo C. parapsilosisno pueden diferenciarse por los métodos fenotípicos clásicos, utilizados corrientemente en los laboratorios de micología; dado que las tres especies que lo componen, presentan las mismas características morfológicas, de crecimiento y perfiles de asimilación y fermentación de azúcares. Sin embargo, esta limitación de los caracteres morfológicos y bioquímicos para diferenciar estas levaduras estrechamente relacionadas, así como la laboriosidad requerida en su estudio y, en algunos casos, la insuficiente resolución que proporcionan a nivel taxonómico, ha propiciado el uso de las técnicas moleculares. En base a la heterogeneidad hallada en las regiones ITS1, ITS2 y la secuencia de ADN ribosomal 5,8s (ADNr), se determinó que este complejo está integrado por levaduras genotípicamente diferentes, y se las denominó C. parapsilosiss.s. (grupo I), C. orthopsilosis (grupo II), y C. metapsilosis (grupo III). El objetivo de este trabajo fue establecer la frecuencia de especies crípticas de las cepas clínicas identificadas originalmente como del complejo C. parapsilosis. Se analizaron 53 cepas identificadas originalmente por métodos fenotípicos, como complejo C. parapsilosis provenientes de aislamientos de muestras clínicas, depositadas en la colección de de la Cátedra de Micología de la Facultad de Ciencias Exactas Químicas y Naturales (FCEQyN) de la Universidad de Misiones (UNaM). Se utilizó la secuenciación de la región ITS1-5,8S- ITS2 para la identificación molecular de cepas catalogadas como complejo C. parapsilosis. En la población analizada, la frecuencia de las distintas especies que integran el complejo C.parapsilosisfue:C. parapsilosiss.s. (grupo I) en una frecuencia del 85% (45/53), C. metapsilosis (grupo III) en un 11% (6/53) y C. orthopsilosis (grupo II) en un 4% (2/53). Se determinó que dentro del complejo C. parapsilosis mantenidas en la colección de cepas de la FCEQyN (UNaM), la especie predominante fue C. parapsilosis s.s., seguida de C. metapsilosisy C. orthopsilosis. Las técnicas moleculares han asistido y complementado a la clasificación. En la actualidad se usan datos moleculares para establecer relaciones filogenéticas entre organismos. Además, representan métodos alternativos al cultivo, cuya intención es mejorar la rentabilidad de las pruebas microbiológicas y se aplican en el diagnóstico de infecciones fúngicas.